Page 46 - 《广西植物》2022年第12期
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２ ０ ３ ６ 广 西 植 物 ４２ 卷
表 ２ 测序数据统计
Ｔａｂｌｅ ２ Ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｄａｔａ ｓｔａｔｉｓｔｉｃｓ
碱基准确率 碱基准确率
碱基总数 碱基准确率 ９９％
Ｒｅａｄｓ 总数 模糊碱基百分比 ９９％以上的 ９９.９％以上的
样品 Ｔｏｔａｌ ｎｕｍｂｅｒ 以上碱基总数
Ｔｏｔａｌ ｎｕｍｂｅｒ Ｎ 碱基所占 碱基所占
Ｓａｍｐｌｅ ｏｆ ｂａｓｅｓ Ｑ３０
ｏｆ Ｒｅａｄｓ (％) 百分比 百分比
(ｂｐ) (ｂｐ)
Ｑ２０ (％) Ｑ３０ (％)
ＦＤＬ ４５ ０４８ ６６２ ６ ７９１ ０８４ ０４２ ６ ３０４ ５５９ ４７５ ０.０００ ２６８ ９７.３６ ９２.８３
ＦＤＲ ４６ ９３９ ２７８ ７ ０７４ ５３１ ４９６ ６ ５２２ ９０３ ９０１ ０.０００ ２９１ ９６.９１ ９２.２０
ＯＤＬ ４４ ５３８ ２６２ ６ ７２５ ２７７ ５６２ ６ ２４０ ２７６ ２９８ ０.０００ ２５０ ９７.２９ ９２.７８
ＯＤＲ ４５ ５５９ ９８８ ６ ８６６ ２６３ ８１２ ６ ３３７ ３６１ ０５７ ０.０００ ２８３ ９６.９４ ９２.２９
ＦＳＲ ３８ ７１６ ６５２ ５ ８０７ ４９７ ８００ ５ ４８１ ２２６ ２８８ ０.０００ ５５６ ９７.９７ ９４.３８
ＦＳＬ ４２ ４３４ ９１４ ６ ３６５ ２３７ １００ ６ ０１４ ４６６ ４９５ ０.０００ ７５０ ９８.０２ ９４.４８
ＯＳＲ ４３ ９８６ ８３４ ６ ５９８ ０２５ １００ ６ ２４７ ０４７ １２９ ０.０００ ７６８ ９８.０８ ９４.６８
ＯＳＬ ４１ １６８ ２０６ ６ １７５ ２３０ ９００ ５ ８３４ ０００ ９４５ ０.０００ ７４９ ９８.０３ ９４.４７
ＦＲ ４１ ８１４ ７１２ ６ ２７２ ２０６ ８００ ５ ９０１ ０５９ ４８９ ０.０００ ７５８ ９７.８３ ９４.０８
ＦＬ ４２ ０４１ ２６２ ６ ３０６ １８９ ３００ ５ ９８２ ８９９ ９４２ ０.０００ ７６４ ９８.２１ ９４.８７
ＯＲ ３８ １９１ ０５４ ５ ７２８ ６５８ １００ ５ ４２９ １５５ ６７５ ０.０００ ７６０ ９８.１１ ９４.７７
ＯＬ ４１ ４９５ ２３２ ６ ２２４ ２８４ ８００ ５ ９１２ ６３６ １７０ ０.０００ ７６９ ９８.２４ ９４.９９
Ｆ. ‘佛奥’ꎻ Ｏ. ‘ＴＹＺ￣１ 号’ꎻ Ｄ. 干旱ꎻ Ｓ. 水淹ꎻ Ｒ. 根ꎻ Ｌ. 叶片ꎮ
Ｆ. ‘Ｆｒａｎｔｏｉｏ’ꎻ Ｏ. ‘ＴＹＺ￣１’ꎻ Ｄ. Ｄｒｏｕｇｈｔꎻ Ｓ. Ｆｌｏｏｄｉｎｇꎻ Ｒ . Ｒｏｏｔꎻ Ｌ. Ｌｅａｆ.
ＰＩ 大于 ７ꎬ平均 ＰＩ 为 ６.６３ꎻ有 ４ 个 ＡＰ２ / ＥＲＦ 转录 其属于油橄榄中 Ｓｏｌｏｓｉｓｔ 类成员ꎬ单独分支可能是
因 子 ( ＯｅＡＰ２￣９７、 ＯｅＡＰ２￣６、 ＯｅＡＰ２￣２８、 ＯｅＡＰ２￣ Ｓｏｌｏｓｉｓｔ 与 ＡＰ２ / ＥＲＦ 转录因子家族其他成员差距
１０９)不稳定系数小于 ４０ꎬ为稳定蛋白ꎬ其余 １０６ 个 较大ꎻ其余 ８６ 个成员都包含 １ 个 ＡＰ２ 保守结构
为不稳 定 蛋 白 ( 不 稳 定 系 > ４０)ꎻ１１０ 个 ＯｅＡＰ２ / 域ꎬ同属于 ＥＲＦ 类ꎬＥＲＦ 类中又包含 ＥＲＦ 和 ＤＲＥＢ
ＥＲＦ 蛋白的脂肪族系数均小于 １００ꎻ预测蛋白信号 ２ 个亚类ꎬ分别与拟南芥 ＥＲＦ 和 ＤＲＥＢ 聚在一起ꎬ
肽发现ꎬ１１０ 个 ＯｅＡＰ２ / ＥＲＦ 蛋白都不存在信号肽ꎬ 总共分为 １２ 个亚组ꎬＥＲＦ 分为 ＥＲＦ Ｂ１ ~ ＥＲＦ Ｂ６ꎬ
为非分泌蛋白ꎻ亚细胞定位中有 ５６ 个 ＯｅＡＰ２ / ＥＲＦ ＤＲＥＢ 分为 ＤＲＥＢ Ａ１ ~ ＤＲＥＢ Ａ６ꎬ除 Ｓｏｌｏｓｉｓｔ 外ꎬ其
蛋白定位于细胞核中ꎬ２８ 个定位于细胞质中ꎬ２５ 余每个亚组中都同时包含 ＡｔＡＰ２ / ＥＲＦ 和 ＯｅＡＰ２ /
个同时定位于细胞质和细胞核中ꎬＯｅＡＰ２￣８５ 定位 ＥＲＦ 蛋白ꎬ说明拟南芥和油橄榄的 ＡＰ２ / ＥＲＦ 家族
于细胞质和线粒体中ꎻ预测二级结构发现ꎬＯｅＡＰ２ / 在进化水平上有一定相似性ꎮ
ＥＲＦ 蛋白无规则卷曲为主要结构ꎬα￣螺旋为次要 ２.５ 油橄榄 ＡＰ２ / ＥＲＦ 保守元件及基因结构分析
结构ꎮ 利用 ＭＥＭＥ 对 ＯｅＡＰ２ / ＥＲＦ 进行保守元件分
２.４ ＯｅＡＰ２ / ＥＲＦ 蛋白进化分析与分类 析ꎬ得到相关性最高的 ６ 个保守元件如图 ４ 所示ꎬ
利用 ＭＥＧＡ Ｘ 对油橄榄 １１０ 个 ＡＰ２ / ＥＲＦ 转 所有的 ＯｅＡＰ２ / ＥＲＦ 都包含 ｍｏｔｉｆ １ꎬ说明 ｍｏｔｉｆ １ 是
录因子蛋白及拟南芥 ３２ 个 ＡＰ２ / ＥＲＦ 蛋白进行系 油橄榄 ＡＰ２ / ＥＲＦ 的保守结构域ꎬ油橄榄 ＡＰ２ / ＥＲＦ
统进化树构建及分析ꎬ结果如图 ３ 所示ꎬＡＰ２ / ＥＲＦ 转录因子的保守元件及基因结构还与其分类相
蛋白总体分为 ４ 类ꎬ其中与拟南芥 ＡＰ２ 类聚在一 关ꎬ在油橄榄 ＡＰ２ / ＥＲＦ 分类中的 ＡＰ２ 类转录因子
起包含 ２ 个 ＡＰ２ 保守结构域的成员共有 ２１ 个ꎬ被 １００％包含 ｍｏｔｉｆ １ꎬ９６.４％包含 ｍｏｔｉｆ ２ꎬ８９.７％包含
分为 ＡＰ２ 类ꎻ 另 外 ２ 个 成 员 ( ＯｅＡＰ２￣２８、 ＯｅＡＰ２￣ ｍｏｔｉｆ ３ꎬ５５. ２％ 包 含 ｍｏｔｉｆ ４ꎬ ３７. ９％ 包 含 ｍｏｔｉｆ ５ꎻ
８７)包含 １ 个 ＡＰ２ 结构域和 １ 个 Ｂ３ 结合域ꎬ与拟 ＲＡＶ 类只包含 ｍｏｔｉｆ １ꎬ可能是由于在进化过程中
南芥 ＲＡＶ 聚在一个分支上ꎬ属于 ＲＡＶ 类ꎻ拟南芥 发生了变异ꎬ导致该类转录因子与其他成员之间
中 Ｓｏｌｏｓｉｓｔ 类蛋白与 ＲＡＶ 类聚在一起ꎬ在 ＲＡＶ 类 没有共同的保守基序ꎻＥＲＦ 类均包含 ｍｏｔｉｆ １ꎬｍｏｔｉｆ
和 Ｓｏｌｏｓｉｓｔ 类旁有一个单独的分支 ＯｅＡＰ２￣６０ꎬ推测 ２ 和 ｍｏｔｉｆ ３ꎻ ＤＲＥＢ 类 均 包 含 ｍｏｔｉｆ １ꎬ ｍｏｔｉｆ ２ 和
