Page 133 - 《广西植物》2023年第2期
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Ｇｕｉｈａｉａ Ｆｅｂ. ２０２３ꎬ ４３(２): ３２７－３３５
ＤＯＩ: １０.１１９３１/ ｇｕｉｈａｉａ.ｇｘｚｗ２０２２０２０４６
李辉ꎬ 冯源恒ꎬ 唐生森ꎬ 等ꎬ ２０２３. 基于转录组测序的枫香 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 引物开发及有效性评价 [Ｊ]. 广西植物ꎬ ４３(２): ３２７－３３５.
ＬＩ Ｈꎬ ＦＥＮＧ ＹＨꎬ ＴＡＮＧ ＳＳꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２３. Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ａｎｄ ｖａｌｉｄｉｔｙ ｅｖａｌｕａｔｉｏｎ ｏｆ Ｌｉｑｕｉｄａｍｂａｒ ｆｏｒｍｏｓａｎａ ＥＳＴ￣ＳＳＲ ｐｒｉｍｅｒｓ ｂａｓｅｄ
ｏｎ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ [Ｊ]. Ｇｕｉｈａｉａꎬ ４３(２): ３２７－３３５.
基于转录组测序的枫香 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 引物开发及有效性评价
李 辉 １ꎬ２ ꎬ 冯源恒 ꎬ 唐生森 ꎬ 杨章旗 １ꎬ２∗
２
２
( １. 广西师范大学 生命科学学院ꎬ 广西 桂林 ５４１００６ꎻ ２. 广西壮族自治区林业科学研究院ꎬ 国家林业和草原局马尾松
工程技术研究中心ꎬ 广西马尾松工程技术研究中心ꎬ 广西优良用材林资源培育重点实验室ꎬ 南宁 ５３０００２ )
摘 要: 枫香是广西重要的乡土树种之一ꎬ具有较高的用材、观赏及药用价值ꎮ 为验证枫香 ＳＳＲ 引物的实
际应用效果ꎬ该研究基于转录组测序技术ꎬ检测枫香 ＳＳＲ 位点并设计引物ꎬ通过 ＰＣＲ 扩增和聚丙烯酰胺凝
胶电泳筛选出具有较高多态性的枫香 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 引物ꎬ并对 １ 个枫香天然群体进行遗传多样性分析ꎮ 结果表
明:(１)共发掘到 ２３ ７７７ 个 ＳＳＲ 位点ꎬ单核苷酸重复类型 ＳＳＲ 位点占总位点比例最高(４６.５４％)ꎬ在重复次
数上 ５~ １２ 次之间的 ＳＳＲ 位点占比最高(７２.３６％)ꎮ (２)共开发出 ２６２ 对 ＳＳＲ 引物ꎬ有效扩增率为 ５３.１％ꎬ最
终筛选出扩增稳定、条带清晰的引物 １８ 对ꎮ (３)多态性检测结果显示所有位点均具有多态性ꎬ天然群体遗
传多样性结果显示该天然群体中等位基因数量(Ｎａ)、有效等位基因数量(Ｎｅ)、Ｓｈａｎｎｏｎ 多样性指数(Ｉ)、观
测杂合度(Ｈｏ)变化范围分别为 ２~ ４、１.１１２ ８~ ２.６０９ ６、０.２０８ ９~ １.１１２ ７ 和 ０.２７５ ９ ~ １.０００ ０ꎬ平均值分别为
２.３３３ ３、１.９５７ ４、０.７０８ ５ 和 ０.７２２ ６ꎮ 综上认为ꎬ枫香中占优势的 ＳＳＲ 位点重复类型和重复基序与其他物种
基本相同ꎬ所开发的 １８ 对枫香 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 引物可以满足开展枫香群体遗传学研究的需要ꎮ 该研究结果为后
续枫香种群遗传多样性研究提供了丰富的标记引物ꎬ对该树种的保护、开发和利用具有重要意义ꎮ
关键词: 枫香ꎬ 转录组ꎬ ＳＳＲ 分子标记ꎬ 引物开发ꎬ 遗传多样性
中图分类号: Ｑ９４３ 文献标识码: Ａ 文章编号: １０００￣３１４２(２０２３)０２￣０３２７￣０９
Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ａｎｄ ｖａｌｉｄｉｔｙ ｅｖａｌｕａｔｉｏｎ ｏｆ Ｌｉｑｕｉｄａｍｂａｒ
ｆｏｒｍｏｓａｎａ ＥＳＴ￣ＳＳＲ ｐｒｉｍｅｒｓ ｂａｓｅｄ ｏｎ
ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ
１ꎬ２
２
２
ＬＩ Ｈｕｉ ꎬ ＦＥＮＧ Ｙｕａｎｈｅｎｇ ꎬ ＴＡＮＧ Ｓｈｅｎｇｓｅｎ ꎬ ＹＡＮＧ Ｚｈａｎｇｑｉ １ꎬ２∗
( １. Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓꎬ Ｇｕａｎｇｘｉ Ｎｏｒｍａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ Ｇｕｉｌｉｎ ５４１００６ꎬ Ｇｕａｎｇｘｉꎬ Ｃｈｉｎａꎻ ２. Ｇｕａｎｇｘｉ Ｆｏｒｅｓｔｒｙ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅꎬ
Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｃｅｎｔｅｒ ｏｆ Ｍａｓｓｏｎ Ｐｉｎｅ ｏｆ Ｓｔａｔｅ Ｆｏｒｅｓｔｒｙ Ａｄｍｉｎｉｓｔｒａｔｉｏｎꎬ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｃｅｎｔｅｒ ｏｆ Ｍａｓｓｏｎ Ｐｉｎｅ
ｏｆ Ｇｕａｎｇｘｉꎬ Ｇｕａｎｇｘｉ Ｋｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆ Ｓｕｐｅｒｉｏｒ Ｔｉｍｂｅｒ Ｔｒｅｅｓ Ｒｅｓｏｕｒｃｅ Ｃｕｌｔｉｖａｔｉｏｎꎬ Ｎａｎｎｉｎｇ ５３０００２ꎬ Ｃｈｉｎａ )
Ａｂｓｔｒａｃｔ: Ｌｉｑｕｉｄａｍｂａｒ ｆｏｒｍｏｓａｎａ ｉｓ ｏｎｅ ｏｆ ｔｈｅ ｉｍｐｏｒｔａｎｔ ｎａｔｉｖｅ ｔｒｅｅ ｓｐｅｃｉｅｓ ｉｎ Ｇｕａｎｇｘｉꎬ ｗｈｉｃｈ ｈａｓ ｈｉｇｈ ｔｉｍｂｅｒꎬ
ｏｒｎａｍｅｎｔａｌ ａｎｄ ｍｅｄｉｃｉｎａｌ ｖａｌｕｅｓ. Ｔｈｉｓ ｓｔｕｄｙ ｄｅｓｉｇｎｓ ａｎｄ ｄｅｖｅｌｏｐｓ ＥＳＴ￣ＳＳＲ ｍａｒｋｅｒｓ ｏｆ Ｌ. ｆｏｒｍｏｓａｎａ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｄａｔａ ｆｒｏｍ
收稿日期: ２０２２－０５－２０
基金项目: 广西科技基地和人才专项(桂科 ＡＤ１９２５４００４)ꎻ 八桂学者专项(２０１９Ａ２６)ꎮ
第一作者: 李辉(１９９５－)ꎬ硕士研究生ꎬ研究方向为生物化学与分子生物学ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)ｌｉｈｕｉ２３３２０２２＠ １６３.ｃｏｍꎮ
∗
通信作者: 杨章旗ꎬ博士ꎬ教授级高级工程师ꎬ研究方向为林木遗传育种ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)ｙａｎｇｚｈａｎｇｑｉ＠ １６３.ｃｏｍꎮ
