Page 138 - 《广西植物》2023年第2期
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３ ３ ２ 广 西 植 物 ４３ 卷
Ｂ１－Ｂ２４. ２４ 个枫香个体ꎻ Ｍ. ５００ ｂｐ ｌａｄｄｅｒ ＤＮＡ Ｍａｒｋｅｒꎮ
Ｂ１－Ｂ２４. ２４ Ｌｉｑｕｉｄａｍｂａｒ ｆｏｒｍｏｓａｎａ ｉｎｄｉｖｉｄｕａｌｓꎻ Ｍ. ５００ ｂｐ ｌａｄｄｅｒ ＤＮＡ Ｍａｒｋｅｒ.
图 １ ２４ 份枫香材料扩增结果 (ＬＦ２２９)
Ｆｉｇ. １ Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ ２４ Ｌｉｑｕｉｄａｍｂａｒ ｆｏｒｍｏｓａｎａ ｕｓｉｎｇ ｐｒｉｍｅｒ (ＬＦ２２９)
表 ５ １８ 对 ＳＳＲ 引物多态性信息
３ 讨论与结论
Ｔａｂｌｅ ５ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｏｎ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ ｏｆ
１８ ｐａｉｒｓ ｏｆ ＳＳＲ ｐｒｉｍｅｒｓ
重复 退火温度 ３.１ 枫香转录组 ＳＳＲ 位点分布特征
引物编号 引物序列 (５′－３′) 基元 Ａｎｎｅａｌｉｎｇ ＳＳＲ 标记具有在植物种间通用性的优点ꎬ同属
Ｐｒｉｍｅｒ Ｎｏ. Ｐｒｉｍｅｒ ｓｅｑｕｅｎｃｅ (５′－３′) Ｒｅｐｅａｔ ｔｅｍｐｅｒａｔｕｒｅ
ｍｏｔｉｆ (℃ ) 植物中移植已有标记进行开发 ＳＳＲ 的研究已不少
ＬＦ５３ Ｆ:ＡＧＧＡＡＣＣＣＡＡＴＴＴＧＡＣＣＣＣＴ (ＴＧＧ) ６ ６０.０ 见(杨世鹏等ꎬ ２０１８)ꎬ而目前可用的枫香 ＳＳＲ 引
Ｒ:ＣＣＡＣＣＣＡＣＣＡＡＴＧＣＴＣＡＧＡＴ
物较少ꎬ仅报道的有顾辛韵(２０１６) 采用磁珠富集
ＬＦ７６ Ｆ:ＣＡＧＣＡＣＴＴＣＣＡＴＡＡＡＧＣＣＧＣ (ＣＣＡＴ) ５ ６０.０
Ｒ:ＧＴＴＣＴＧＡＣＧＣＣＴＴＣＴＧＧＴＧＡ 法开发的 １０ 对引物及孙荣喜(２０１７)通过 ＮＣＢＩ 数
ＬＦ８９ Ｆ:ＴＧＡＡＡＴＴＴＴＧＣＧＴＧＧＧＣＴＧＧ (ＧＧＣＴ) ５ ５７.３
Ｒ:ＡＣＡＡＧＴＧＧＧＣＴＣＡＡＡＴＧＡＧＴ 据库信息开发了 １１ 对引物ꎮ 磁珠富集法主要是
ＬＦ１０８ Ｆ:ＧＣＡＡＴＡＧＣＣＧＴＴＣＣＣＴＴＴＧＣ (ＴＴＣＴ) ５ ６０.０
Ｒ:ＣＡＣＧＧＴＣＴＣＡＣＴＧＣＣＴＧＡＴＴ 通过构建微卫星富集文库ꎬ经阳性克隆、筛选、测
ＬＦ１１１ Ｆ:ＣＧＧＡＧＣＴＣＧＴＧＡＴＴＴＣＡＧＧＴ (ＴＴＴＣ) ５ ６０.６
Ｒ:ＡＧＡＡＣＣＧＧＴＴＣＣＴＣＧＴＡＡＣＡ 序最终得到 ＳＳＲ 位点信息ꎬ这两个方法在一定程
ＬＦ１１２ Ｆ:ＡＴＣＡＧＴＧＴＧＴＡＧＧＣＣＧＡＡＣＣ (ＴＴＴＧ)５ ５８.６ 度上提高了 ＳＳＲ 引物开发效率ꎬ但操作过程繁琐
Ｒ:ＡＧＣＣＡＡＴＣＡＣＣＡＣＡＣＡＣＣＡＡ
且需要构建和筛选基因组文库ꎬ开发难度较大ꎬ获
ＬＦ１２８ Ｆ:ＣＡＣＡＣＣＡＣＴＣＣＡＣＴＣＣＧＡＴＣ (ＣＣＡ) ７ ６０.０
Ｒ:ＡＴＧＴＴＧＡＧＧＧＡＧＣＧＡＡＧＧＴＧ
得的 ＳＳＲ 位点信息有限ꎻ通过 ＮＣＢＩ 数据库开发
ＬＦ１２９ Ｆ:ＧＴＡＴＧＡＴＣＧＣＣＣＴＣＣＣＡＣＴＧ (ＣＣＧ) ７ ６０.０
Ｒ:ＡＣＡＧＡＡＧＣＴＧＡＧＧＴＴＧＡＧＧＣ
ＬＦ１７１ Ｆ:ＡＣＴＣＡＣＡＣＴＣＣＣＡＣＡＣＴＣＣＡ (ＣＣＴ) ８ ６０.０ ＳＳＲ 引物的方法使得研究者可以从中获得有效信
Ｒ:ＡＡＡＣＴＣＧＡＡＧＡＣＣＣＡＧＣＧＡＧ 息ꎬ节省了时间和成本ꎬ但当前数据库中的枫香序
ＬＦ１７７ Ｆ:ＣＣＡＣＴＧＣＣＴＣＡＧＧＧＴＴＴＣＴＴ (ＧＡＡＧ) ６ ６０.０
Ｒ:ＣＴＴＣＡＣＣＴＧＧＡＡＧＴＧＧＧＴＣＧ 列数据有限ꎬ能获得的 ＳＳＲ 位点信息较少且无法
ＬＦ１８８ Ｆ:ＴＴＣＴＧＴＧＡＣＴＧＧＧＣＡＡＴＧＧＧ (ＴＡＡ) ８ ５９.８
Ｒ:ＣＧＡＧＴＣＣＴＣＡＣＡＴＴＣＣＡＣＧＴ 对枫香 ＳＳＲ 位点信息分布特征进行详细描述ꎮ 随
ＬＦ１９０ Ｆ:ＴＧＧＴＧＣＣＴＴＣＴＴＧＧＡＣＣＴＴＴ (ＴＡＴＴ) ６ ６０.０
Ｒ:ＣＡＣＡＡＣＡＡＡＣＧＡＧＧＡＡＧＣＣＧ 着高通量测序技术的发展ꎬＲＮＡ￣ｓｅｑ 测序的成本正
ＬＦ２０６ Ｆ:ＣＡＡＡＴＧＣＧＡＡＴＧＡＧＣＧＧＧＡＧ (ＡＡＡＧＧ) ５ ６０.０ 逐渐降低ꎬ基于转录组数据开发 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 分子标
Ｒ:ＧＧＧＣＡＡＡＡＧＧＧＡＣＡＧＧＡＴＧＴ
记ꎬ目前已成为基因发掘及分子标记开发的重要
ＬＦ２２４ Ｆ:ＡＣＡＧＧＣＴＧＴＧＧＧＡＴＴＡＧＣＡＣ (ＧＡＡＧＧ) ５ ６０.０
Ｒ:ＧＴＣＧＴＣＡＧＡＧＴＧＧＣＣＡＧＡＡＡ
ＬＦ２２９ Ｆ:ＧＣＴＡＣＣＧＴＴＧＣＣＴＣＣＴＴＣＡＴ (ＴＴＴＣＣ) ５ ５９.８ 技术手段ꎮ 本研究首次通过转录组测序技术获得
Ｒ:ＴＧＧＴＣＴＴＧＧＡＧＣＡＧＡＴＧＡＣＧ
ＬＦ２４２ Ｆ:ＴＣＴＣＡＴＣＧＣＡＣＴＣＣＴＡＧＧＧＴ (ＧＡＡ) ９ ６０.０ 了相对较多且较全面的枫香 ＳＳＲ 位点信息ꎮ 本研
Ｒ:ＧＴＧＡＧＴＧＧＡＧＡＧＧＧＧＧＡＧＡＴ
究发现ꎬ作为第三纪的孑遗植物ꎬ枫香转录组中 ＳＳＲ
ＬＦ２４５ Ｆ:ＧＴＧＣＴＧＧＡＴＣＴＣＴＧＧＣＡＣＡＡ (ＧＣＡ) ９ ５９.９
Ｒ:ＧＡＣＣＡＡＴＧＴＡＴＣＣＣＧＧＧＧＡＣ 基元重复类型较为丰富ꎬ包含了 ６ 种核苷酸重复的
ＬＦ２４７ Ｆ:ＧＧＡＡＧＴＡＣＣＡＣＴＣＣＴＴＣＧＧＣ (ＧＣＧ) ９ ６０.０
Ｒ:ＧＡＡＡＣＴＣＣＧＡＡＴＴＣＧＡＣＧＣＧ 所有类型ꎬ 高比例的单核苷酸重复序列(４６.５４％)
