Page 28 - 《广西植物》2025年第4期
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                 and sex marker ̄assisted breeding of C. axillaris. Differential expression of male and female transcriptomesꎬ the
                 distribution and sequence characteristics of SSR locus were analyzedꎬ and SSR locus miningꎬ development and validation
                 were conducted based on the transcriptome data. The results were as follows: (1) A total of 40 341 Unigenes sequences
                 were obtained from male and female transcriptomes of C. axillaris. The total lengthꎬ the length of N50ꎬ average length
                 and GC content were 52 806 369 bpꎬ 2 409 bpꎬ 1 309 bpꎬ and 38.75%ꎬ respectively. A total of 1 949 differentially
                 expressed genes between males and females were screenedꎬ among which 1 052 genes were significantly upregulated and
                 897 genes were downregulated in males compared to females. (2) Among all Unigenesꎬ 5 251 SSR loci were detected
                 with 619 Unigenes sequences containing two or more SSR lociꎬ resulting in an SSR occurrence frequency of 11.18% and
                 an average distribution distance of 10. 06 kb. Among all SSR lociꎬ dinucleotide repeats accounted for the highest
                 proportion (46.95%)ꎬ followed by trinucleotide repeats (34.27%). (3) A total of 20 pairs of SSR polymorphic primers
                 were obtained through screening and validationꎬ detecting 80 alleles among 85 samplesꎬ with an average polymorphism
                 information content (PIC) of 0.56. In summaryꎬ the sequencing quality of C. axillaris is highꎬ and the assembly effect is
                 good. The 20 pairs provide a reference for the analysis of population genetic diversityꎬ sex marker ̄assisted breeding and
                 fingerprints construction of C. axillaris.
                 Key words: Choerospondias axillarisꎬ primer developmentꎬ transcriptomeꎬ SSRꎬ locus characteristics




                 南 酸 枣 ( Choerospondias axillaris) 为 漆 树 科     域气候不同ꎬ其表型性状、生长特性、营养成分、抗
            (Anacardiaceae)南酸枣属(Choerospondias) 植物ꎬ别           性以及物候期等方面存在较大变异ꎬ并在我国亚
            名五眼果、广枣、人面子等ꎬ系蒙古族习用药材(中                            热带和热带地区长期进化中积累了丰富的种内遗
            国科学院中国植物志编辑委员会ꎬ1980)ꎮ 其树皮                          传变异(叶学敏等ꎬ2019ꎻ尧云萍等ꎬ2021ꎻ买凯乐
            用于制备栲胶和鞣料、果实可食用或药用ꎬ并具有                             等ꎬ2022)ꎮ 作为雌雄异株的南酸枣ꎬ其长期异交
            较高的 材 用 价 值 ( 苏 永 精 等ꎬ 2023ꎻ 李 若 熙 等ꎬ              导致基因型高度杂合、缺乏同属物种参考以及丰
            2023)ꎮ 南酸枣广泛分布于我国南方ꎬ是重要的速                          富的分子标记ꎬ这限制了其遗传评价和分子辅助
            生造林树种ꎬ兼具经济、生态和社会效益(高阳等ꎬ                            育种工作ꎬ不利于其进化潜力以及未来发展的分
            2021ꎻZhang et al.ꎬ 2022ꎻ杨观兰等ꎬ2022ꎻ李景恩等ꎬ            析ꎬ从而使其分子研究进展缓慢( 吴谡琦等ꎬ2001ꎻ
            2024)ꎮ 此外ꎬ作为东亚特有单属植物ꎬ它是亚热                          谷振军等ꎬ2019)ꎮ
            带、热带落叶阔叶林的重要组成部分ꎮ 古地理研究                                物种的遗传多样性是其进化潜力和适应环境
            表明ꎬ南酸枣属植物可能起源于早始新世的欧洲ꎬ                             能力的重要指标ꎬ能为物种应用与开发提供理论依
            并沿温暖湿润的特提斯洋扩散到亚洲ꎬ东亚南酸枣                             据(Magurranꎬ 1988)ꎮ 通过分子标记对物种进行遗
            属的分布格局形成可能出现于晚中新世之前(Liang                          传多样性分析ꎬ不仅对种质资源的收集、保存、评价
            et al.ꎬ 2022)ꎮ 东亚地区自渐新世以来有连续的南                     和利用等提供重要借鉴ꎬ而且还为遗传学深层次研
            酸枣属化石记录ꎬ显示出较高的适应性ꎮ 福建中新                            究奠定基础ꎮ 例如ꎬ叶金山等(2015)对南酸枣 ISSR
            世的南酸枣化石ꎬ与现代南酸枣形态差异比较大ꎬ                             的 PCR 反应体系进行优化ꎻ谷振军等(2019)对南酸
            其中远 古 南 酸 枣 形 态 比 现 代 “ 子 孙” 更 加 多 样               枣 SSR 分子标记进行初步探索ꎻ杨春霞等(2018)对
            (Wang et al.ꎬ 2020)ꎮ 南酸枣与漆树科的盐肤木属                  南酸枣叶片和果实进行了转录组测序ꎬ获得大量数
            (Rhus)植物在分布范围情况上有相似之处ꎬ盐肤木                          据ꎻZhang 等(2021) 对南酸枣叶绿体全基因组进行
            属植物起源于早始新世的北美西部ꎬ在中始新世期                             测序ꎬ为进一步开展南酸枣分子遗传学研究奠定了
            间间断分布在亚洲和北美ꎮ 吴泽玲(2023) 研究认                         基础ꎮ 然而ꎬ目前发布的基因库中未查询到序列数
            为ꎬ亚洲东部特殊的地形及气候可能保留了这两个                             据ꎬ分子标记序列信息也未明确报道ꎬ限制了南酸
            属ꎮ 南酸枣很早就在欧洲消失ꎬ但在中国华南地区                            枣分子层面的遗传多样性研究ꎮ

            可能一直存在至今(Wang et al.ꎬ 2020)ꎮ                           微卫星分子标记作为目前应用最为广泛的分
                 南酸枣具有较强适应性ꎬ能在温度和降水变                           子标记之一ꎬ具有突变快、多态性和稳定性高、重
            化较大的区域生长(李冬等ꎬ2020)ꎮ 但是ꎬ由于地                         复性好、分布广泛等优点ꎬ被广泛应用于遗传评
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