Page 27 - 《广西植物》2025年第4期
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Ｇｕｉｈａｉａ Ａｐｒ. ２０２５ꎬ ４５(４): ６４１－６５３
ＤＯＩ: １０.１１９３１/ ｇｕｉｈａｉａ.ｇｘｚｗ２０２４０６０２２
徐梦阳ꎬ 蔡宇宇ꎬ 李婷ꎬ 等ꎬ ２０２５. 南酸枣转录组特征分析及 ＳＳＲ 标记开发 [Ｊ]. 广西植物ꎬ ４５(４): ６４１－６５３.
ＸＵ ＭＹꎬ ＣＡＩ ＹＹꎬ ＬＩ Ｔꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２５. Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ ａｎｄ ＳＳＲ ｍａｒｋｅｒ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ Ｃｈｏｅｒｏｓｐｏｎｄｉａｓ
ａｘｉｌｌａｒｉｓ [Ｊ]. Ｇｕｉｈａｉａꎬ ４５(４): ６４１－６５３.
南酸枣转录组特征分析及 ＳＳＲ 标记开发
徐梦阳 ꎬ 蔡宇宇 ꎬ 李 婷 ꎬ 吴南生 ꎬ 孙荣喜 １ꎬ２∗
１ꎬ２
１ꎬ２
１ꎬ２
１ꎬ２
( １. 江西农业大学 林学院 南酸枣研究所ꎬ 南昌 ３３００４５ꎻ ２. 江西农业大学 林学院
亚热带森林资源培育江西省重点实验室ꎬ 南昌 ３３００４５ )
摘 要: 通过对南酸枣(Ｃｈｏｅｒｏｓｐｏｎｄｉａｓ ａｘｉｌｌａｒｉｓ)雌雄转录组特征进行分析及 ＳＳＲ 标记开发ꎬ为其遗传评价和
性别分子辅助育种提供理论支撑和科学依据ꎮ 该文主要分析南酸枣雌雄转录组表达差异ꎬＳＳＲ 位点的分布
及序列特征ꎬ在此基础上开展 ＳＳＲ 位点挖掘ꎬ并进行 ＳＳＲ 引物的开发和有效性验证ꎮ 结果表明:(１)南酸枣
转录组测序共获得 ４０ ３４１ 条 Ｕｎｉｇｅｎｅｓ 序列ꎬ总长度、Ｎ５０ 长度、平均长度和 ＧＣ 含量分别为 ５２ ８０６ ３６９ ｂｐ、
２ ４０９ ｂｐ、１ ３０９ ｂｐ 和 ３８.７５％ꎻ共筛选到 １ ９４９ 个雌雄差异表达基因ꎬ其中雄株比雌株显著上调的基因有
１ ０５２ 个ꎬ下调的基因有 ８９７ 个ꎮ (２)在所有 Ｕｎｉｇｅｎｅｓ 中共检测到 ５ ２５１ 个 ＳＳＲ 位点ꎬ６１９ 条 Ｕｎｉｇｅｎｅｓ 序列中
含有 ２ 个及 ２ 个以上位点ꎬＳＳＲ 发生频率为 １１.１８％ꎬ平均分布距离为 １０.０６ ｋｂꎻ在所有 ＳＳＲ 位点中ꎬ二核苷
酸重复所占比例最高(４６.９５％)ꎬ其次为三核苷酸重复(３４.２７％)ꎮ (３) 经筛选及有效性验证共得到 ２０ 对
ＳＳＲ 多态性引物ꎬ在 ８５ 份资源中共检测到 ８０ 个等位基因ꎬ平均多态性信息含量(ＰＩＣ) 为 ０.５６ꎮ 综上认为ꎬ
南酸枣叶片转录组测序质量较高ꎬ组装效果较好ꎮ ２０ 对多态性引物为后期遗传评价、性别辅助育种及指纹
图谱构建提供参考ꎮ
关键词: 南酸枣ꎬ 引物开发ꎬ 转录组ꎬ ＳＳＲꎬ 位点特征
中图分类号: Ｑ９４３ 文献标识码: Ａ 文章编号: １０００￣３１４２(２０２５)０４￣０６４１￣１３
Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ ａｎｄ ＳＳＲ ｍａｒｋｅｒ
ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ Ｃｈｏｅｒｏｓｐｏｎｄｉａｓ ａｘｉｌｌａｒｉｓ
１ꎬ２ １ꎬ２ １ꎬ２ １ꎬ２ １ꎬ２∗
ＸＵ Ｍｅｎｇｙａｎｇ ꎬ ＣＡＩ Ｙｕｙｕ ꎬ ＬＩ Ｔｉｎｇ ꎬ ＷＵ Ｎａｎｓｈｅｎｇ ꎬ ＳＵＮ Ｒｏｎｇｘｉ
( １. Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｏｆ Ｃｈｏｅｒｏｓｐｏｎｄｉａｓ ａｘｉｌｌａｒｉｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈꎬ Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ｆｏｒｅｓｔｒｙꎬ Ｊｉａｎｇｘｉ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ Ｎａｎｃｈａｎｇ ３３００４５ꎬ Ｃｈｉｎａꎻ
２. Ｊｉａｎｇｘｉ Ｐｒｏｖｉｎｃｉａｌ Ｋｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆ Ｓｕｂｔｒｏｐｉｃａｌ Ｆｏｒｅｓｔ Ｒｅｓｏｕｒｃｅｓ Ｃｕｌｔｉｖａｔｉｏｎꎬ Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ｆｏｒｅｓｔｒｙꎬ
Ｊｉａｎｇｘｉ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ Ｎａｎｃｈａｎｇ ３３００４５ꎬ Ｃｈｉｎａ )
Ａｂｓｔｒａｃｔ: Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ ａｎｄ ＳＳＲ ｍａｒｋｅｒ ｗａｓ ｄｅｖｅｌｏｐｅｄ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｔｈｅ ｌｅａｆ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ
ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｃｈｏｅｒｏｓｐｏｎｄｉａｓ ａｘｉｌｌａｒｉｓ ｉｎ ｏｒｄｅｒ ｔｏ ｐｒｏｖｉｄｅ ｔｈｅｏｒｅｔｉｃａｌ ｓｕｐｐｏｒｔ ａｎｄ ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ ｂａｓｉｓ ｆｏｒ ｇｅｎｅｔｉｃ ｅｖａｌｕａｔｉｏｎꎬ
收稿日期: ２０２４－１１－３０ 接受日期: ２０２４－１２－２４
基金项目: 国家自然科学基金(３２１６０３８７)ꎮ
第一作者: 徐梦阳(１９９９—)ꎬ硕士研究生ꎬ主要从事林木遗传育种研究ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)１２４０７３２３６９＠ ｑｑ.ｃｏｍꎮ
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通信作者: 孙荣喜ꎬ博士ꎬ副研究员ꎬ研究方向为林木遗传育种及种质资源评价ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)ｒｏｎｇｘｉｓｕｎ＠ １６３.ｃｏｍꎮ
